O tratamento é cirúrgico e dependerá do grau de comprometimento do pênis pelo tumor e do tipo histológico das células tumorais. Poderá variar de uma simples retirada do tumor ( raro de acontecer), uma amputação parcial do pênis ou em casos mais avançados a uma retirada total do pênis(amputação total). Na presença de um órgão genital totalmente comprometido poderá ser indicada a emasculação total ( retirada da lesão, testículos e bolsa escrotal). Este procedimento não tem caráter curativo,  e visa manter a possibilidade de convívio social do paciente com seus familiares.
A retirada dos linfáticos inguinais ( gânglios linfáticos inguinais) poderá ser indicada ao se retirar a lesão tumoral peniana e isto tem finalidade de cura ou retardo da evolução da doença. A retirada tardia  dos mesmos gânglios pode não ser benéfica  e a evolução da doença poderá  ser agressiva e rápida.